Um antigo funcionário da Bungie que trabalhou no desenvolvimento de Marathon descreveu a experiência de trabalho como “extremamente tóxica e humilhante”. Conhecido online como Spirited, o programador esteve envolvido na engenharia do jogo e exprimiu a sua simpatia pelos colegas que ainda fazem parte da equipa.
De acordo com a Spirited, a liderança das equipas de engenharia e design de Marathon foi o principal fator de insatisfação, chegando mesmo a afirmar que a liderança da Bungie precisa de uma grande reformulação. Ele fazia parte da equipa responsável pelos serviços online do jogo, que foi dissolvida pouco depois da sua saída numa vaga de despedimentos. Antes de trabalhar em Marathon, Spirited esteve envolvido na produção de Destiny.
O antigo funcionário recusou-se a fornecer mais pormenores, tendo insistido no facto das suas opiniões serem pessoais e de não ter intenção de violar qualquer acordo de confidencialidade (NDA).
A par destas declarações, Marathon tem sido criticado por alegações de plágio nas obras de arte utilizadas no jogo. Além disso, fontes internas indicam que o ambiente na Bungie está num momento delicado, com a moral da equipa a atingir níveis muito baixos. Há uma preocupação generalizada entre os funcionários sobre o futuro do estúdio, especialmente no caso de um fracasso comercial de Marathon, algo que consideram crítico para a sobrevivência da Bungie.